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Les virus — Transcript

by KhanAcademyFrancophone · 3,428 words · 516 segments · language en · Watch on YouTube

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0:00les virus sont à mon avis les entités
0:01les plus fascinantes de toute la
0:03biologie car ils bruit vraiment la
0:05frontière entre ce qu'est un objet
0:07inanimé et ce qu'est la vie mais qu'est
0:09ce que la vie exactement si on regarde
0:11les humains et les autres êtres vivants
0:13on peut facilement dire que toutes ces
0:15choses sont vivantes parce qu'on les
0:17voit naître grandir et changer en
0:19permanence et parfois ces choses bougent
0:22parfois non mais elles sont toutes
0:25capables de métaboliser ce qui les
0:26entoure et de se reproduire avant de
0:28mourir et oui cela ressemble à la
0:31définition de la vie non et dans cette
0:33catégorie on peut placer la plupart des
0:35choses que l'on rencontre il ya bien sûr
0:37nous mais aussi les bactéries et les
0:41plantes bon je suis ici en train de
0:44massacrer la taxonomie ce système qui
0:46permet de classer le vivant mais c'est
0:48juste pour te montrer qu'on sait
0:49généralement reconnaître la vie quand on
0:51la croise or les virus ne sont qu'un tas
0:54d'informations génétiques protégé à
0:56l'intérieur d'une capsule protéique et
0:59le jeune homme qu'ils transportent peut
1:00prendre n'importe quelle forme ça peut
1:02être donc de la rn ou de l'adn qui
1:06lui-même peut être simple brin ou double
1:08bras s'il s'agit d'un arn un simple brin
1:10par exemple on ajoute un petit s est un
1:13petit b à la suite du sigle arn si on
1:17parle d' adn double bras on écrit adn db
1:20toutes les formes de virus existent mais
1:23le principe de base c'est qu'ils
1:25contiennent de l'information génétique
1:26donc une chaînes d'acides nucléiques
1:28sous la forme soit des arn simple ou
1:31double bras souad adn simples ou doubles
1:34heureux et ce génome se trouve à
1:36l'intérieur d'un certain type de
1:38structure protéique que l'on appelle la
1:41capside la représentation classique
1:43d'une capside donne une sorte d'icône
1:45cèdre et si j'arrive à la dessiner
1:47correctement cela ressemble à quelque
1:49chose dans ce genre mais tous les virus
1:51n'ont pas exactement cette forme il
1:54existe des milliers de types de virus et
1:56on ne va quand déflorer la surface dans
1:58cette vidéo pareil pour ce qui concerne
2:01les différentes techniques de
2:02réplication des virus et ces derniers
2:04ont probablement recours à toutes les
2:06stratégies possibles pour se multiplier
2:08mais on verra tout ça en détail un peu
2:10plus tard pour résumer
2:12virus ne sont vraiment que des caps site
2:14protéique elle même constituée d'un tas
2:16de petites protéines assembler ensemble
2:18et à l'intérieur se trouve le matériel
2:22génétique du virus qui est soit de l'adn
2:24soit de la rn la capside n'est pas
2:27vraiment transparente mais si c'était le
2:29cas on verrait du matériel génétique à
2:31l'intérieur mais est-ce qu'un virus est
2:33quelque chose de vivant il semble plutôt
2:35unanimes et il ne grandit pas ne change
2:37pas et nommé d'abolir rien pris
2:39séparément c'est une chose inerte qui
2:41reste là comme un livre posé sur une
2:43table et sa présence ne change rien mais
2:46ce qui semble n'être qu'un assemblage de
2:48molécules s'anime tout d'un coup en
2:50présence de ce que l'on considère comme
2:52vivant et c'est de là que vient le débat
2:55si on considère ce qu'un virus fait
2:56classiquement et bien il s'attache à une
2:59cellule donc je vais dessiner ici en
3:01plus petit
3:03disons que ce petit hexagone est un
3:05virus et qu il va s attacher à une
3:08cellule cela peut être n'importe quel
3:10type de cellules une bactérie une
3:11cellule végétale ou encore de cellules
3:14humaines je vais dessiner une cellule et
3:16cie qui est généralement donc beaucoup
3:18plus grosse qu'un virus dans le cas des
3:20cellules qui ont des membranes molle le
3:21virus trouve facilement un moyen d'y
3:23pénétrer je ne veux pas compliqué
3:25l'histoire mais parfois le virus s'est
3:27entouré de sa propre membrane comme ça
3:30autour de sa capside on verra dans
3:32quelques minutes d'où le virus tire sa
3:34membrane et sa membrane va simplement
3:36fusionner avec celle de la cellule ce
3:39qui permet au virus d'entrer dans la
3:41cellule il s'agit là d'une première
3:43méthode et les différents virus pénètre
3:45rarement de la même manière dans une
3:47cellule une autre méthode ressemble à
3:49une sorte de cheval de troie car la
3:51cellule ne veut pas de virus ce dernier
3:53doit donc la convaincre qu'il n'est pas
3:55une particule étrangères grâce à des
3:58récepteurs protéique présents à la
3:59surface du virus ou à la surface des
4:01cellules on pourrait faire des centaines
4:03de vidéos sur fonctionnement des virus
4:05car c'est un domaine actifs de recherche
4:07parfois le virus peut simplement être
4:10engloutis par la cellule qui considère
4:12qu'elle doit le consommer donc la
4:14cellule l'entourent comme ça
4:16ses côtés finissent par fusionner et le
4:18virus se retrouve à l'intérieur de la
4:20cellule
4:21c'est ce qu'on appelle landolt cie toews
4:22on en parle dans une autre vidéo dont
4:24candau site aux la cellule importe le
4:28virus dans son cytoplasme et cela
4:31n'arrive pas qu'aux virus d'ailleurs
4:33mais ça fait partie des mécanismes
4:35d'entraidé virus si la cellule en
4:38question est entouré d'une coque très
4:39durs comme c'est le cas des bactéries
4:42d'ailleurs je lui en ai dessiné je vais
4:43en dessiner une ici dans une autre
4:45couleur le virus ne pénètre pas dans la
4:48cellule il s'accroche juste à
4:51l'extérieur comme ça bon mon dessin
4:53n'est pas à l'échelle mais les virus
4:55injecte en fait leur matériel génétique
4:57dans la bactérie en fin de compte il
5:01existe une grande variété de stratégies
5:02pour l'entrée des virus dans les
5:04cellules mais ce qu'il faut retenir
5:06c'est qu'en général ils entrent dans la
5:08cellule une fois à l'intérieur ils
5:10libèrent leur matériel génétique qui
5:12flotte alors dans le cytoplasme il est
5:14possible que tous les modes de
5:15fonctionnement imaginables exil c'est
5:17dans la nature pour les virus même si
5:18les chercheurs ne les ont pas encore
5:20découvert mais ce que l'on connaît déjà
5:22sont très différents les uns des autres
5:24donc si le génome viral est déjà sous
5:27forme d'arène ce dernier est
5:28immédiatement exploitables disons qu'ici
5:30c'est le noyau de la cellule qui
5:32renferme de l' adn que je vais
5:34représenter dans une autre couleur ici
5:37on sait que l'adn est généralement
5:39transcrit en arn quand la cellule
5:41fonctionnent normalement la rn sort du
5:43noyau et s'associe au ribosome puis la
5:46rnt arrive et des protéines sont
5:48produites la rn en code différentes
5:50protéines comme on l'a vu dans une autre
5:52vidéo et c'est ainsi que les protéines
5:54se forment et éventuellement participer
5:56aux différentes structures d'une cellule
5:58mais le virus détourne ce processus à
6:00son profit il prend le contrôle de ce
6:03mécanisme et cet arn va essentiellement
6:05faire ce que la rn2 la cellule aurait
6:08fait en commençant par exprimer ses
6:10propres protéines de toute évidence il
6:12ne va pas encoder la même chose que les
6:14arn cellulaire d'ailleurs parmi les
6:16premières protéines virales quillan code
6:18il y en a qui digère l'adn et la rn
6:20cellulaire afin d'éliminer toute
6:23concurrence donc les rênes virale en
6:25cause ses propres protéines qui fabrique
6:27ensuite d'autres cap site viral en même
6:30temps que la rn se réplique grâce au
6:32piratage des processus cellulaires
6:34isoler la rn du virus ne produit rien
6:37mais une fois libéré dans la cellule il
6:40utilise l'ensemble de la machinerie
6:42cellulaire pour se répliquer et c'est
6:44assez incroyable d'imaginer tous les
6:46processus biochimiques qui interviennent
6:48derrière tout ça ensuite ces molécules d
6:50arn se retrouve enfermé dans les capside
6:52lorsqu'il il ya assez de particules
6:54virales produite grâce aux mécanismes
6:56cellulaires et que la cellule a
6:58pratiquement épuisé toutes ses
6:59ressources les nouveaux virus sorte de
7:01la cellule d'une manière ou d'une autre
7:03le mécanisme de sortie le plus connu on
7:05ne peut pas dire le plus typique parce
7:07que les chercheurs n'ont peut-être pas
7:09encore découvert tous les types de virus
7:11qui existent mais celui dont on parle le
7:13plus implique la fabrication de
7:14protéines qui provoque la mort de la
7:16cellule où la dissolution de sa membrane
7:18donc la membrane seront on dit que la
7:21cellule est lisais je vais l'écrire ici
7:24donc on parle de lise cellulaire ce qui
7:29signifie simplement que la membrane de
7:30la cellule disparaît ce qui permet à
7:32tous les nouveaux virus de s'échapper
7:34tout à l'heure on a vu que certains
7:36virus disposent de leurs propres membres
7:38mais d'où viennent ces membrane
7:39lipidique et bien certains virus sorte
7:43de la cellule après s'y être répliqué
7:45sans induire sally's donc sans la tuer
7:47il s'agit là d'un exemple spécifique
7:49mais les différents types de virus
7:51exploite et combine vraiment toutes les
7:52stratégies possibles de réplication de
7:55codage des protéines et d'échappement
7:56des cellules donc pour revenir à notre
7:59exemple certains virus sorte simplement
8:01hambourg gens dans à partir de la
8:03membrane de la cellule ils poussent en
8:06quelque sorte contre la membrane ou la
8:07paroi cellulaire en fait on ne devrait
8:09pas parler de parois cellulaires mais de
8:11membrane externe de la cei et à force de
8:13pousser contre la membrane les virus
8:15emportent avec eux une partie de cette
8:17dernière et on peut imaginer l'utilité
8:19de cette membrane en effet cela permet
8:21au virus de ressembler mois un corps
8:23étranger ce qui constitue un avantage
8:25pour infecter une autre cellule c'est
8:26donc un moyen de se faire passer pour ce
8:28qu'il n'est pas et si tout cela te
8:30semble plutôt effrayant sache qu'en plus
8:32de pirates et la machinerie d'une
8:33cellule les virus peuvent carrément en
8:36modifier l'adn c'est le cas du vih
8:39le vih est un rétrovirus
8:42il contient de la rn et quand ils se
8:44retrouvent dans une cellule comme ceux
8:46ci il apporte avec lui une protéine
8:50les d'où vient cette protéine l'ensemble
8:52de la particule virale provient d'une
8:54autre cellule dont les virus utilise les
8:56acides aminés les ribosomes les acides
8:59nucléiques et tout le reste pour se
9:00construire ainsi toutes les protéines
9:03qu'ils contiennent sont issus d'une
9:05autre cellule et le vih apporte avec lui
9:07une protéine la transcriptase inverse
9:09qui prend en charge les arn viral et le
9:12convertit en adn elle permet donc de
9:14passer de la rn à de l'adn la découverte
9:17de cette enzyme à renverser paradigme
9:19selon lequel on procédait toujours dans
9:21le sens adn vera et rennes mais la
9:24transcriptase inverse des codes la rn en
9:26adn et pour couronner le tout l'adn du
9:29virus s'incorpore à l'adn de la cellule
9:31hôte que je suis en train de dessiner
9:33ici en jaune entouré par son noyau le
9:36vih alter donc le matériel génétique de
9:39la cellules qu'il infecte dans les
9:40vidéos sur les bactéries on a vu que
9:42pour une cellule humaine on a vingt
9:44cellules bactériennes et ses dernières
9:46partagent notre vie elles font partie de
9:48nous elles nous sont très utiles et
9:50représente 10% de notre masse sèche ce
9:53sont donc des compagnons de vie qui ne
9:54changent en rien notre constitution
9:55génétique mais les rétrovirus e altère
9:58notre matériel génétique il touche à nos
10:01gènes qui définissent qui on est et
10:03c'est en s'intégrant à notre adn que ces
10:05virus produisent leur propre protéines
10:07en exploitant le processus classique qui
10:10transforme l'adn en arn puis en
10:12protéines l'adn viral peut parfois resté
10:15dormant dans la cellule sans rien faire
10:17jusqu'à ce qu'il reçoive un stimulus de
10:18l'environnement il recommence alors à
10:20s'exprimer et à produire des virus et ce
10:23directement à partir de l'adn de
10:25l'organisme le rétrovirus fait donc
10:27désormais partie de l'organisme qu'il a
10:29infecté étant donné qu'il figure dans
10:31son adn on parle de pro virus quand le
10:34virus est intégré à l'adn de l'hôte
10:37imaginons maintenant qu'un virus de ce
10:39type infecte une cellule de mon nez ou
10:41de mon bras
10:43eh bien à mesure que cette cellule
10:45enchaîne les cycles de mitose toute sa
10:47descendance qui lui est génétiquement
10:49identique va contenir l'adn du virus
10:52mais ce n'est pas si grave car le virus
10:55infecte ici des cellules somatiques
10:58mes enfants ne vont donc pas hérité du
11:00projet russe et ce dernier ne va pas non
11:02plus faire partie de mon espèce mais
11:05s'il infecter des cellules germinales là
11:07ce serait embêtant on a vu que ce sont
11:10les cellules germinales qui produisent
11:12les gamètes c'est à dire les cellules
11:13sexuelles pour les hommes il s'agit des
11:15spermatozoïdes et pour les femmes ce
11:18sont les ovules et comme tu peux
11:20l'imaginer si ce virus infecte mais
11:22c'est le germinal jeu peut alors
11:24transmettre son adn à mes enfants qui
11:27vont à leur tour le transmettre à leurs
11:28enfants et ainsi de suite et ça ça fait
11:31froid dans le dos on estime que 5 à 8
11:34pour cent du génome humain
11:37vient d'anciens rétrovirus qui se sont
11:40intégrés à l'adn de nos cellules
11:42germinales et donc à celui de notre
11:45espèce ce chiffre varie d'un site à
11:48l'autre mais tourne autour de 5 à 8% et
11:51il se base sur l'étude de notre adn et
11:54sa comparaison avec celui d'autres
11:55organismes ces anciens rétrovirus sont
11:58qualifiés de rétrovirus endogènes et
12:01leur existence remet en question ce qui
12:03est vraiment l'espèce humaine parce que
12:05cela n'a rien à voir avec les bactéries
12:07qui nous accompagne au quotidien on ne
12:09parle pas juste de choses qui vivent
12:11avec nous et nous aide ou nous rendre
12:12malade ici on dit carrément que 5 à 8%
12:16de notre adn provient de ces virus là et
12:19ceux ci participent à la variabilité
12:21génétique on parle de transfert
12:23horizontal l'adn tout à l'heure j'ai
12:25représenté le vpro virus ici en bleu qui
12:29vient donc du virus qui a infecté à
12:30l'origine la cellule est en jaune donc
12:33c'est l'adn historique de l'hôte on peut
12:36imaginer qu'à mesure que le virus passe
12:38d'une espèce à une autre disons d'une
12:40espèce à à une espèce b il mute pour
12:43être capable d'infecter les cellules de
12:44l'espèce b lorsque le premier russe
12:46s'exprime et produit de nouveau virus
12:47ces derniers contiennent l'adn du pro
12:50virus dont ils sont issus mais il arrive
12:52parfois que les nouveaux virus repartent
12:54en plus avec une portion de adn de
12:56l'aude il est possible que la majorité
12:58de leur génome viennent du virus
13:00d'origine mais lors de la réplication
13:02virale donc lors de la transcription et
13:05de la traduction du pwt-virus une
13:07fraction de l'adn de l'organisme est
13:09incorporé au génome des nouveaux virus
13:11le virus emporte donc des portions de
13:14l'adn d'un organisme qu'il apporte
13:16ensuite un autre organisme au sein de la
13:18même espèce et de la même manière il
13:21peut transférer de l'adn entre deux
13:23espèces différentes l'adn sont ainsi
13:25d'une espèce à une autre ce qui montre à
13:27quel point tout est interconnecté en
13:29tant qu'espèce on pense qu'on est tout
13:31seul et qu'on peut uniquement se
13:32reproduire les uns avec les autres et
13:35générer ainsi de la variabilité
13:36génétique au sein de la population
13:39mais les virus introduit cette notion de
13:40transfert horizontal par transduction et
13:43la transduction repose sur l'idée qu'au
13:45cours de sa réplication le virus peut
13:47prélever un peu la dn2 l'organisme hôte
13:49et le transférer à l'adn du prochain
13:52organisme qu'il infecte
13:54donc on a vraiment de l'adn qui voyagent
13:56d'un organisme à un autre et qui unifie
13:59en quelque sorte toutes les formes de
14:00vie à à bagdad et m c'est à dire toute
14:02la vie que l'on connaît sur terre parmi
14:04toutes les autres classes de virus l'une
14:06des plus étudiées et celle qui attaquent
14:07les bactéries elle est très importante
14:09parce qu'elle pourrait constituer une
14:11alternative aux antibiotiques il s'agit
14:13de la classe des bactériophages on en a
14:15rapidement parlé tout à l'heure avec ces
14:17virus qui contiennent de l'adn et qui
14:19restent à l'extérieur de la bactérie et
14:21la membrane externe de la bactérie étant
14:23très résistante et bactériophages ce
14:25qu'on tente d'injecter leur adn à
14:27l'intérieur de la bactérie on a aussi vu
14:28que parfois le virus induit la lyse des
14:30cellules et j'ai oublié de te donner le
14:32terme exact dont tu aura peut-être
14:35besoin pour tes examens de biologie en
14:37fait on parle de cycle lithiques et si
14:40on revient à la notion de prouvy russe
14:42où le virus incorpore son adn dans le
14:45génome de la cellule hôte et res dormant
14:47pendant un certain temps on parle alors
14:49de cycle l'iso génique chez les
14:51eucaryotes ces organismes qui dispose
14:53d'une enveloppe nucléaire autour de leur
14:55adn le pro virus a essentiellement ainsi
14:57que l'iso génique mais en général quand
15:00on parle de cycle l'iso génique on fait
15:02plutôt référence à l'adn du
15:03bactériophages qui est dormant dans
15:06l'adn de la bactérie pour illustrer tout
15:08ça et te donner une idée de l'échelle
15:11des choses voici deux photos qui
15:12viennent de wikipédia celle de gauche
15:14provient du centre de contrôle et de
15:16prévention des maladies aux etats unis
15:18elle est en noir et blanc à l'origine
15:19mais elle a été colorisées pour faire
15:22ressortir certains détails cette gauche
15:24aux bleus que tu vois ici c'est un
15:25globule blanc et toutes ces petites
15:27boules vertes qui bourgeonnent à partir
15:29de la surface du globule blanc ce sont
15:31des virus vih 1 le vih et d'un
15:35rétrovirus qui affecte les globules
15:37blancs et cause le sida ce syndrome qui
15:40se déclare quand notre système
15:41immunitaire est extrêmement affaibli les
15:44malades du sida souffle alors
15:45d'infection qui n'affecte pas les
15:47personnes avec un système immunitaire
15:48normal c'est effrayant quand on y pense
15:51c'est minuscule chose pénètre dans cet
15:54énorme cellules et détourne tout sa
15:56machinerie dans le but de répliquer leur
15:58propre adn ou arn et de produire tout
16:01c'est protéine de capside et ensuite ils
16:04bourgeonnent à partir de cette cellule
16:05et emportent avec eux une partie de sa
16:07membrane il laisse même une partie de
16:09leur adn dans le génome du globule blanc
16:10donc ils modifient vraiment cette
16:12cellule prenons notre image
16:15donc ici ce sont des bactériophages
16:19qui sont accrochés à la membrane externe
16:21d'une bactérie juste là en orange
16:25et vu que la membrane externe et rigide
16:28ils ne peuvent pas fusionner avec elle
16:30les bactériophages reste donc en surface
16:33et injecte leur matériel génétique dans
16:35la bactérie ce qui est hallucinant c'est
16:38de comparer la taille de ces virus avec
16:40celle de la bactérie on dirait une
16:41grosse planète et les bactériophages
16:43sont tellement plus petit et mesure à
16:46peu près 1 100e de la taille de la
16:47bactérie prenons notre image ces virus
16:50mesure encore moins d'un centième de la
16:52taille du globule blanc ce sont des
16:54particules tellement petit qu'il est
16:55très difficile de les filtrer et donc de
16:58les maintenir à distance certes il
17:00existe des virus qui sont encore plus
17:02commun que le vih ebola ou le strass
17:04c'est le cas notamment des virus à
17:07l'origine des rhumes si tu attrapes un
17:09rhume cela signifie qu'un virus a
17:11affecté le tissu de ta cavité nasale et
17:14c'est à cause de lui que ton est cool
17:15par exemple la varicelle ou encore les
17:18boutons de fièvre sont aussi dus à des
17:19virus commun ils sont partout ils nous
17:21entoure en permanence ce qui nous ramène
17:23à la question presque philosophique
17:25qu'on a posés au début de cette vidéo
17:27ces choses sont elles vivantes j'ai pu
17:29voir qu'il s'agit de protéines
17:30assemblées autour d'une molécule d'acide
17:32nucléique et que c'est plutôt quelque
17:34chose d'inertes qui ne bouge pas ne
17:36semble pas vivre n'a pas de métabolisme
17:39ne mange rien et ne se reproduit pas
17:41mais quand on repense à tout ce qu'un
17:43virus fait à une cellule et à comment il
17:46se sert d'elle pour se reproduire on
17:48dirait vraiment qu'il suit une stratégie
17:49de type réduction des coûts comme dans
17:51le monde de la finance en effet le virus
17:54n'a pas besoin de toute cette machinerie
17:55parce qu'il peut utiliser celles des
17:57autres organismes pour se répliquer on a
17:59presque envie de le considérer comme une
18:01forme de vie plus intelligente parce que
18:03contrairement aux autres il ne se
18:04complique pas la vie on peut donc se
18:06demander ce qu'est la vie ce que nous
18:08sommes réellement sommes nous des
18:10organismes dotés d'adr ou seulement des
18:13moyens de transporter cet adn et c'est
18:15là que c'est important car les
18:17infections virales sont le siège de
18:19véritables batailles entre adn arn et
18:21toutes les autres formes qui existent
18:23dans la nature
18:24mais le but de cette vidéo n'est pas de
18:26philosopher mais plutôt de te permettre
18:27de mieux comprendre ce que sont les
18:28virus et pourquoi à mon sens ce sont les
18:31pseudos organismes les plus fascinants
18:33de toute la biologie

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