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Como Preparar Gel de Poliacrilamida 12% para SDS-PAGE em 5 Passos Rápidos! 🔬🧪 — Transcript

by Bruno Mayer · 2,897 words · 439 segments · language en · Watch on YouTube

Full transcript

  1. 0:00Olá, pessoal. Eu sou Bruno Maer, sou
  2. 0:02biomédico e pesquisador aqui da
  3. 0:03Universidade Federal de Ciências e Saúde
  4. 0:04de Porto Alegre e no vídeo de hoje a
  5. 0:06gente vai preparar um gel de
  6. 0:07poliacrilamida a 12%. Então vamos comigo
  7. 0:13[Música]
  8. 0:16acompanhar. Então a gente vai ã colocar
  9. 0:19plástico filme na bancada para proteger
  10. 0:20a
  11. 0:21bancada, que a gente não quer contaminar
  12. 0:25a bancada com acrilamida, que eu já vou
  13. 0:27mostrar para vocês o problema
  14. 0:34dela. Então a gente separa um local
  15. 0:37aonde a gente vai trabalhar com
  16. 0:38acrilamida para não contaminar essa
  17. 0:40bancada, porque como vocês podem ver
  18. 0:42aqui, a acrilamida ela líquida, ela é a
  19. 0:46acrilamida líquida, ela é tóxica. Então
  20. 0:48tanto pro contato com a pele, com os
  21. 0:50olhos, ela é cancerígena, então é um
  22. 0:52produto que a gente não quer derramar na
  23. 0:54bancada ou encostar nele. Então sempre
  24. 0:56que a gente for trabalhar com a
  25. 0:58piramida, a gente vai trabalhar usando
  26. 0:59as luvas. Aqui a gente vai utilizar
  27. 1:02esses moldes de vidro, então, para
  28. 1:04colocar o gel aqui dentro do molde.
  29. 1:05Depois vocês vão acompanhando no vídeo.
  30. 1:07Primeira coisa que a gente vai fazer é
  31. 1:09higienizar esses vidros. Muito bem.
  32. 1:11Então, com álcool 70 e um pouco de
  33. 1:12papel, a gente vai fazer a limpeza dos
  34. 1:14nossos
  35. 1:20[Música]
  36. 1:28moldes. Certo? Então, com os moldes
  37. 1:31limpos, a gente pode preparar esses
  38. 1:33moldes. A gente vai est utilizando um
  39. 1:34kit da marca Biohrad para montar a
  40. 1:37estrutura onde o gel vai ficar ali
  41. 1:39dentro, né? Como se fosse montar
  42. 1:42uma, como é que eu posso dizer isso? Um
  43. 1:45molde pro gel, né? Então, a gente pode
  44. 1:47notar aqui no vidro que ele tem uma
  45. 1:50partezinha mais elevada, né? Quando a
  46. 1:53gente coloca o vidro em cima
  47. 1:56dele, ele forma um uma espécie de
  48. 2:00vãozinho aonde o gel aqui no meio. Então
  49. 2:04posicionado. Aqui a própria placa da Bio
  50. 2:07ela já diz escrito a parte que tem que
  51. 2:09ficar para cima. Então tem uma seta
  52. 2:10apontando para cima e a parte up. Então
  53. 2:12eu vou só colocar esse vidro aqui, vou
  54. 2:14deixar ele bem alinhado um com o outro e
  55. 2:17vai ficar dessa forma
  56. 2:19aqui. Daí para colocar no molde, a gente
  57. 2:22pode deixar o molde aberto. Ele tem um
  58. 2:24como se fosse uma porteirinha. Dessa
  59. 2:27forma ele tá fechado e aí dessa forma
  60. 2:29ele tá aberto. Então eu coloco o nossos
  61. 2:32o vidro aqui dentro e aí prendo eles
  62. 2:36fechando dessa forma assim, ó.
  63. 2:38Agora o vidro tá preso aqui e aí tá
  64. 2:42pronto já para entrar no molde depois no
  65. 2:44nosso nosso aparato de plástico ali.
  66. 2:46Então eu vou montar esse primeiro que a
  67. 2:48gente vai fazer dois g ao mesmo
  68. 2:50tempo. O segundo a mesma coisa. A parte
  69. 2:53up para cima, a gente coloca o vidro.
  70. 2:56Então alinha eles dois. Vai ficar dessa
  71. 3:00maneira. A gente abre o aparato e então
  72. 3:05coloca ele o vidro aqui dentro.
  73. 3:09A gente pode usar até a própria bancada
  74. 3:10para alinhar esses vidros aqui. E aí
  75. 3:14fecha essas abinhas dele, vai dar um
  76. 3:17estralinho e aí tá conectado. Então aqui
  77. 3:19dentro vai ser onde a gente vai pipetar
  78. 3:22o gel nessa parte de cima. E esse furo
  79. 3:24de baixo a gente vai fechar depois ele
  80. 3:27com essa borrachinha aqui, colocando ali
  81. 3:29no molde. Já mostro mais à frente no
  82. 3:32vídeo. A gente vai utilizar esse suporte
  83. 3:34aqui da Bioad para fazer a montagem do
  84. 3:35gel. Então, primeiro a gente coloca o
  85. 3:37suporte e coloca aquelas borrachinhas de
  86. 3:39vedação na parte de baixo dele. Então
  87. 3:42elas vão encaixadas aqui nessa nessa
  88. 3:44área destinada para
  89. 3:46elas. Depois de colocar a borracha de
  90. 3:48vedação, ela é que vai vedar a parte de
  91. 3:51baixo do gel. Então a gente vai encostar
  92. 3:53aqui os os pezinhos do aparato.
  93. 3:56Encaixamos ele aqui e levantamos a
  94. 3:58presilha.
  95. 4:00E aí colocamos o gel aqui. E essa
  96. 4:02presilha então vai pressionar o vidro
  97. 4:05contra aquela borracha, fazendo com que
  98. 4:07não vaze o líquido ali por baixo. Então
  99. 4:09aqui a gente vai colocar o segundo gel
  100. 4:11também
  101. 4:12encaixado no nosso aparato ali, os
  102. 4:14pezinhos encaixados. E aqui então o
  103. 4:17nosso suporte para receber o gel, para
  104. 4:19receber a primeira a primeira camada de
  105. 4:21gel. A gente vai fazer dois tipos de gel
  106. 4:23diferente, um gel de empilhamento e um
  107. 4:25gel de corrida. Então, esse é o molde já
  108. 4:28prontinho e agora a gente vai pra
  109. 4:29preparação do líquido do que vai virar o
  110. 4:32gel. Então, posteriormente. Então, nessa
  111. 4:34próxima etapa a gente vai precisar de
  112. 4:36alguns tubos
  113. 4:37Falcon. A gente vai fazer então dois
  114. 4:39géis. O primeiro gel que a gente vai
  115. 4:41fazer vai ser o gel de corrida, onde a
  116. 4:43gente vai pipetar ele no vidro, depois
  117. 4:46sobrepor com um pouco de água, depois a
  118. 4:48gente tira a água e coloca um gel de
  119. 4:50empilhamento. Mas a gente então vai
  120. 4:51fazer o gel de corrida nesse primeiro
  121. 4:53falcon aqui, só seguindo as instruções e
  122. 4:56as medidas que a gente vai colocar aqui
  123. 4:58na tela. O primeiro ingrediente, então,
  124. 4:59que a gente vai colocar aqui para fazer
  125. 5:01o gel é a acrilamida. Então, a gente vai
  126. 5:03utilizar aqui uma uma acrilamida com
  127. 5:05bisacrilamida. Então é uma, por isso gel
  128. 5:07de poliacrilamida, mistura de duas
  129. 5:09acrilamidas. Hã, 4 ml, então, ou 4000
  130. 5:14microl aqui no nosso
  131. 5:26foco. Pipetados 4 ml, então, da
  132. 5:28crilamida aqui dentro, é sempre
  133. 5:30importante lembrar que até as ponteiras
  134. 5:32que a gente pipeta a crilamida, elas
  135. 5:34ficam contaminadas e têm que ser
  136. 5:35descartadas em local apropriado. o
  137. 5:37descarte de poliacrilamida e a gente
  138. 5:40coloca então aqui dentro para ser
  139. 5:41descartado depois adequadamente, até
  140. 5:43porque esse reagente aqui, como eu
  141. 5:44comentei anteriormente, ele é
  142. 5:46cancerígeno. Todas as recomendações
  143. 5:48aqui. Então o segundo o segundo
  144. 5:50ingrediente então que a gente vai
  145. 5:52adicionar no nosso gel é um TRZ HCL de
  146. 5:55pH 8,8 para o gel de corrida. um
  147. 5:59reagente que a gente preparou
  148. 6:00previamente, mas no próximo vídeo a
  149. 6:02gente pode também mostrar como que se
  150. 6:03prepara esse tris aqui. Então, desse
  151. 6:06trozo a gente vai pipetar
  152. 6:08373 microl. Então, primeiro eu vou
  153. 6:11pipetar 3.000 e depois eu vou
  154. 6:13complementar com os outros 73.
  155. 6:21Então aqui eu já terminei de pipetar
  156. 6:23então esse volume 3733 do nosso Tris HCL
  157. 6:27PH
  158. 6:288.8. O nosso próximo ingrediente então
  159. 6:31que a gente vai adicionar é um pouco de
  160. 6:33água desse
  161. 6:34lado. Então aqui a gente já separou um
  162. 6:37tubo Falcon com um pouco de água e o
  163. 6:39volume então que a gente vai colocar é
  164. 6:41de
  165. 6:422107 microl.
  166. 6:46Então, primeiro eu vou pipetar
  167. 6:562.000. Então, o nosso próximo
  168. 6:58ingrediente que a gente vai colocar é o
  169. 7:00SDS a
  170. 7:0110%. Então, são 100 microl que a gente
  171. 7:04vai colocar aqui. 100 microl.
  172. 7:14Então, o nosso próximo ingrediente aqui
  173. 7:16nessa receita é o APS, também a 10%,
  174. 7:19geralmente ele fica congelado aqui na
  175. 7:21nossa mão, a gente já descongelou ele
  176. 7:23para poder pipetar. Então, na solução, a
  177. 7:25gente vai utilizar aqui 50 microl
  178. 7:32dele. E por fim, a gente vai usar um
  179. 7:36Tmed, apenas 10 microl. E a partir então
  180. 7:39do contato do Temmed com APS, é que vai
  181. 7:42começar de fato a solidificação dessa
  182. 7:44solução aqui. Então a gente vai
  183. 7:46adicionar os 10
  184. 7:51microled e a partir daí vai começar a
  185. 7:54parte de formação de gel mesmo
  186. 7:56propriamente
  187. 8:00dita. Então eu vou fechar aqui o meu meu
  188. 8:03frasco, meu volume final 10 ml. Quer
  189. 8:06dizer que deu tudo certo as medidas que
  190. 8:08a gente pipetou aqui. Vou fazer uma
  191. 8:12mistura e depois de algumas inversões, a
  192. 8:15gente já pode pipetar isso aqui no nosso
  193. 8:17suporte. Então agora a gente vai pipetar
  194. 8:205 microlros em cada um dos nossos
  195. 8:28suportes para que o gel faça a sua
  196. 8:31solidificação na parte na parte interior
  197. 8:34do vidro. Então, encosta minha
  198. 8:42pipeta. A gente tem que observar se ele
  199. 8:44também não tá vazando por algum local.
  200. 8:46Então, depois de colocar o primeiro ml,
  201. 8:48a gente verifica se não tem nenhum
  202. 8:49vazamento aqui na nossa estrutura. E aí
  203. 8:52eu posso colocar o segundo ml.
  204. 8:58Então a gente sempre vai pipetar entre
  205. 9:01os vidros e o gel, então ele vai
  206. 9:03solidificar entre os vidros.
  207. 9:29Feito o primeiro, a gente vai pro
  208. 9:31segundo. Mesma coisa. pipetamos o
  209. 9:33primeiro ml e a gente observa então se
  210. 9:35não há nenhum vazamento do do gel pela
  211. 9:38borracha que deve que deve vedar o vidro
  212. 9:40ali embaixo.
  213. 10:07M.
  214. 10:11Depois de pipetado então esse volume de
  215. 10:135 ml em cada um dos vidros, a gente vai
  216. 10:16completar o restante do volume do vidro
  217. 10:17com
  218. 10:19água para que a água então ela pressione
  219. 10:22o gel e fique
  220. 10:26retinho. Não tô vendo o gel ali, mas
  221. 10:29tudo
  222. 10:30bem. Então aqui eu só vou
  223. 10:32completar e
  224. 10:35vazou. Esse aqui vazou. né?
  225. 10:40Ó, é esse da esquerda aqui, o gel ele
  226. 10:44vazou aqui embaixo, então a gente acabou
  227. 10:46perdendo esse gel. E o nosso gel da
  228. 10:49direita, a gente consegue ver que o
  229. 10:51volume dele continua na no local onde
  230. 10:53deveria. Então a gente vai
  231. 10:56colocar Então, a gente vai colocar a
  232. 10:58água na parte superior aqui do
  233. 11:02gel. Pode ver que a água começa a se
  234. 11:04separar do gel, eles não se misturam. E
  235. 11:07é justamente isso que a gente espera. A
  236. 11:09água vai pressionando o
  237. 11:13gel e vai formar uma linha de separação
  238. 11:16entre o que é gel e o que é água depois,
  239. 11:18quando ele se solidificar.
  240. 11:28Então gente, como vocês podem ver, esse
  241. 11:30primeiro gel aqui não tava bem vedada a
  242. 11:33borracha, ele acabou vazando. Podem ver
  243. 11:35como o líquido da acrilamida, ele desce
  244. 11:37pra bancada e acabaria contaminando a
  245. 11:39bancada se a gente não tivesse então
  246. 11:41colocado esse plástico aqui que a gente
  247. 11:43vedou bem. Então, por isso sempre se
  248. 11:45atentar para os procedimentos básicos de
  249. 11:47biossegurança. Colocando o plástico
  250. 11:49filme aqui, a gente já evitou um
  251. 11:51problema de contaminar a bancada e
  252. 11:53depois poder contaminar algum outro
  253. 11:55colaborador aqui do laboratório. Às
  254. 11:57vezes, né, muitas vezes os nossos
  255. 11:59ferimentos não dá certo e a gente
  256. 12:01precisa repetir. Então, esse primeiro
  257. 12:02gel aqui, a gente não vai conseguir
  258. 12:04aproveitar ele. A gente pode até remover
  259. 12:07e vamos dar segmento só com aquele que
  260. 12:09que deu certo até o momento. Então,
  261. 12:12dando continuidade aqui, a gente esperou
  262. 12:14um tempo o gel solidificar. É importante
  263. 12:17lembrar que alguns climas frios isso
  264. 12:19pode demorar um pouco mais e num clima
  265. 12:21quente ele solidifica um pouco mais
  266. 12:23rápido. Como a gente vai saber que o gel
  267. 12:25solidificou? A gente vai ter que tirar
  268. 12:27ele aqui do suporte e olhar ele contra a
  269. 12:30luz. Não sei se na câmera vai pegar, não
  270. 12:32sei se a câmera vai conseguir focar
  271. 12:34muito bem, mas aqui existe uma linha que
  272. 12:37a gente consegue visualizar onde divide
  273. 12:40o que é o gel e o que é a água. E agora
  274. 12:43a gente vai levar até a pia e vai
  275. 12:44remover essa água aqui de cima e aí vai
  276. 12:47fazer uma secagem para então colocar o
  277. 12:48gel de empilhamento aqui no local onde
  278. 12:50tá a água. Então a gente vai ali pra pia
  279. 12:52agora. Então aqui na pia a gente vai só
  280. 12:55eh despejar essa água
  281. 12:58aqui por inversão e a gente pode ver que
  282. 13:00o gel ele tá sólido ali dentro do vidro
  283. 13:03enquanto a água começa a escorrer aqui
  284. 13:05no lado. Então a gente já pode inverter
  285. 13:07ele consegue ver bem o gel aqui dentro
  286. 13:10do vidro. Então agora a gente vai secar
  287. 13:12o vidro com papel filtro. Então eu pego
  288. 13:15um pedaço dele e vou só tirar o excesso
  289. 13:17de água que fica aqui dentro do do nosso
  290. 13:20filtro. Eu tento não encostar aqui com o
  291. 13:23papel no gel, só para não estragar ele
  292. 13:26ali. Então aqui a gente vai tirar o
  293. 13:28excesso de água e vai deixar ele seco
  294. 13:31aqui, tanto por fora e por dentro.
  295. 13:33Então, depois de remover toda essa água
  296. 13:35aqui de cima, a gente vai colocar ele
  297. 13:37novamente no
  298. 13:39suporte. E a gente então vai colocar
  299. 13:42agora um gel de empilhamento aqui em
  300. 13:44cima. A gente vai preparar esse gel e
  301. 13:46vai pipetar ele aqui na parte superior
  302. 13:48do nosso vidro. Então agora a gente vai
  303. 13:49preparar o gel de empilhamento. Eu já
  304. 13:51separei mais um tubo Falcon aqui e a
  305. 13:53gente vai pipetar os mesmos ingredientes
  306. 13:55que a gente pipetou no gel de corrida,
  307. 13:57só que no de empilhamento a concentração
  308. 14:00e a disposição desse desse gel é um
  309. 14:02pouco diferente. Então a gente vai
  310. 14:04começar pipetando novamente a
  311. 14:06acrilamida, só que agora a gente vai
  312. 14:08pipetar 1000
  313. 14:13microl, ok? 1000 microl 1 ml de
  314. 14:17acrilamido, certo? O segundo
  315. 14:19ingrediente, então, que a gente vai
  316. 14:20pipetar é o tri HCL. Só que agora a
  317. 14:23diferença é que esse
  318. 14:25tr. E a gente vai pipetar então 780
  319. 14:35microll. Nosso terceiro ingrediente,
  320. 14:38então, é o FDS a 10% e a gente vai
  321. 14:41pipetar 60 microll.
  322. 14:50Nosso quarto ingrediente é apenas água
  323. 14:52deste lado e a gente vai pipetar aqui
  324. 14:554124 ml.
  325. 15:08[Aplausos]
  326. 15:12Depois a gente vai colocar o APS 30
  327. 15:15microl. Vou pegar no congelador. Então
  328. 15:18agora a gente vai colocar 30 microl de
  329. 15:20APS.
  330. 15:29E por último, 6 microl apenas do
  331. 15:42Temed. A gente vai dar uma homogeneizada
  332. 15:44nisso aqui. Então, a gente dá uma
  333. 15:46homogeneizada no tubo depois de
  334. 15:48misturado. Então, então aqui o volume
  335. 15:50final são 6 ml, a gente usaria três para
  336. 15:54cada gel. Como no nosso caso aqui, a
  337. 15:57gente acabou ficando apenas com um gel,
  338. 15:58a gente vai usar só 3 ml desse desse
  339. 16:01tubo.
  340. 16:03Então, e agora a gente vai colocar então
  341. 16:05o gel de empilhamento na parte
  342. 16:07superior aqui do nosso gel de corrida.
  343. 16:11Então, primeiro ele vai correr no
  344. 16:12empilhamento, vai se ajustar e depois
  345. 16:14vai de fato para o gel de corrida. Tá
  346. 16:17aqui vão ser mais ou menos 3 ml,
  347. 16:20dependendo do tamanho do do seu vidro aí
  348. 16:22que estiver
  349. 16:36usando. Eu vou deixar um espacinho neste
  350. 16:39final aqui, porque a gente vai colocar
  351. 16:41os espaçadores para formar os pocinhos
  352. 16:44aonde a gente vai pipetar a nossa
  353. 16:45amostra.
  354. 16:46Então eu vou pegar o espaçador. Então
  355. 16:49este aqui é um espaçador que a gente vai
  356. 16:50utilizar. Então quando enfiar aqui ele
  357. 16:52no gel e o gel cristalizar, solidificar.
  358. 16:56Depois vão ficar os pocinhos aonde a
  359. 16:57gente vai conseguir pipetar a nossa
  360. 16:59amostra para fazer a corrida o SDS page.
  361. 17:02A minha dica aqui é você sempre colocar
  362. 17:04o espaçador em uma maneira que que ele
  363. 17:07não entre reto todo de uma vez. E também
  364. 17:10pode perceber que ele tem a parte de da
  365. 17:11frente e essa parte de trás, né? A parte
  366. 17:15que fica virada pra frente é onde tá
  367. 17:17escrito aqui a marca do aparelho Bioad.
  368. 17:20E ele também tem uma tipo uma
  369. 17:23sobressalência aqui nessa parte. Então a
  370. 17:25gente tenta enfiar ele dessa forma assim
  371. 17:28lateralmente que vai entrando um
  372. 17:30dentinho de cada vez para evitar que
  373. 17:31forme bolhas de ar ali dentro. Se a
  374. 17:34gente acaba colocando ele todo de uma
  375. 17:35vez e reto, forma muita bolha de ar e
  376. 17:38daí isso daí vai ser ruim depois pra
  377. 17:40gente pipetar a nossa amostra e pode
  378. 17:42atrapalhar na corrida.
  379. 17:44Então, por que que eu não enchi também
  380. 17:46ele de gel? Justamente porque depois eu
  381. 17:49ia ter que colocar o
  382. 17:52espaçador. Então, colocando ele
  383. 17:55aqui. E aí eu pressiono ele até o final.
  384. 17:59Pode ver que ainda derramo um pouquinho
  385. 18:00de
  386. 18:02líquido. Então, vou fazer até uma,
  387. 18:06pode ver que derramou um pouco de
  388. 18:07líquido. Eu vou secar um pouco
  389. 18:09desse desse nosso gel que derramou.
  390. 18:16E agora então a gente só aguarda a
  391. 18:19solidificação. No nosso caso aqui, como
  392. 18:21tá bem frio, a gente vai colocar ele
  393. 18:23numa estufa a 25º, 23º, uma temperatura
  394. 18:26ambiente para que solidifique mais
  395. 18:29rápido. Bom, então depois de esperar um
  396. 18:31tempinho, a gente consegue ver que o gel
  397. 18:33também se cristaliza aqui nessa parte de
  398. 18:35cima e a gente já pode remover então do
  399. 18:37suporte.
  400. 18:39Então eu abro essas abinhas que a gente
  401. 18:41trancou no começo e tiro o nosso vidro
  402. 18:45pela parte
  403. 18:46superior. Eu posso tanto remover o meu
  404. 18:49espaçador aqui ou posso guardar o gel.
  405. 18:52No caso, a gente vai não vai correr esse
  406. 18:53gel agora. Então eu vou embalar ele e
  407. 18:55guardar na geladeira para ser usado num
  408. 18:57outro dia. Então vou mostrar para vocês
  409. 18:59o processo também de guardar esse gel e
  410. 19:02deixar ele úmido ali na geladeira.
  411. 19:06Então, a gente pode envolver ele com um
  412. 19:10papel, um papel toalha mesmo comum. A
  413. 19:14gente aí a gente envolve ele
  414. 19:22aqui. E aí a gente põe um pouquinho de
  415. 19:24água destilada para umedecer o papel.
  416. 19:30E a gente consegue ver que já é um pouco
  417. 19:32mais fácil de lidar com
  418. 19:36ele. Caso a gente não tenha derramado
  419. 19:38nada, a gente poderia até usar esse
  420. 19:40mesmo papel filme aqui para embalar ele,
  421. 19:43mas como o nosso a nossa policrilamida
  422. 19:45acabou vazando, então eu vou utilizar
  423. 19:48um plástico aqui para envolver
  424. 19:52ele que seja
  425. 19:58novinho. Então aqui ele fica
  426. 20:00embaladinho. a gente faz a identificação
  427. 20:03aqui desse gel, coloca o nosso nome, ã,
  428. 20:06diz o que que é, que é um gel de
  429. 20:07poliacrilamida 12%, ou a gente guarda
  430. 20:10ele num local identificado. Então, a
  431. 20:13gente já tem a nossa identificação aqui
  432. 20:15no laboratório e daqui ele vai pra
  433. 20:17geladeira, então, pra gente correr este
  434. 20:19gel num próximo vídeo, tá bom? Vejo
  435. 20:22vocês no próximo vídeo. Obrigado por
  436. 20:24acompanhar e se inscreva no canal que a
  437. 20:26gente tá chegando aos 1000 inscritos.
  438. 20:28Até o próximo.
  439. 20:31[Música]

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